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En las células eucariotas la mayor parte del código genético está dentro del núcleo celular, pero también hay orgánulos dentro del citoplasma que contienen ADN, que es llamado mADN o ADN mitocondrial para diferenciarlo del ADN nuclear.

El código con el que las mitocondrias representan las proteínas es parecido al nuclear, pero no es igual, hay algunas diferencias. Veamoslas, con el siguiente orden: primero ponemos el codón, luego lo que representa en el código mitocondrial y detrás separado por ; lo que significa en el código estándar:

AGA: Stop; Arg (Arginina)/ AGG: Stop; Arg (Arginina)/ AUA: Met (metionina); ile (isoleucina)/ UGA: Trp (tripsina); Stop